MYD88 L265P Mutacja somatyczna w makroglobulinemii Waldenströma AD 5

Spośród 4 pacjentów, którzy byli homozygotyczni pod względem MYD88 L265P, 2 miało dodatni wywiad rodzinny (stanowiący 22% wszystkich pacjentów z dodatnim wywiadem rodzinnym), a 2 miało przypadki sporadyczne (stanowiące 11% wszystkich pacjentów ze sporadycznymi przypadkami) ( P = 0,84). Nie stwierdzono powtarzających się wariantów somatycznych w innych genach kodujących szlaki sygnalizacyjne Toll-podobne lub NF-.B u 10 pacjentów z parami próbek. Kolejne najczęstsze warianty somatyczne, po MYD88, wystąpiły w bogatym w AT genu interaktywnej domeny 1A (ARID1A) i genie H1e histonu (HIST1H1E), z wariantami występującymi w każdym z tych genów u 2 z 10 pacjentów ze sparowaniem próbki (20%). Dwa niepowtarzające się warianty pojedynczego nukleotydu zidentyfikowano przez sekwencjonowanie całego genomu w każdym genie i potwierdzono przez sekwencjonowanie Sangera (patrz Tabela S2 w Dodatku Uzupełniającym). Trzech dodatkowych pacjentów z niesparowanymi próbkami miało warianty w ARID1A, a status somatyczny został potwierdzony przez sekwencjonowanie Sanger normalnej tkanki. Dlatego 5 z 30 pacjentów (17%) miało mutację w ARID1A, w tym trzy warianty pojedynczego nukleotydu prowadzące do przedwczesnego skrócenia białka (po jednym w R173, Q547 i Q934) i dwie zmiany przesunięcia ramki odczytu (usunięcie w pozycji 27057944 i wstawienie w pozycji 27107136 w chromosomie 1). Pacjenci z mutacjami L265P ARID1A i MYD88, w porównaniu z pacjentami, którzy nie mieli mutacji ARIDIA, mieli większy udział choroby szpiku kostnego (90% w porównaniu z 50%, P = 0,08), niższy hematokryt (26% w porównaniu do 32% , P = 0,03) i niższą liczbę płytek krwi (168 000 na milimetr sześcienny w porównaniu do 207 000 na milimetr sześcienny, P = 0,08). Nie stwierdzono wariantów somatycznych w HIST1H1E u żadnego z pacjentów z niesparowanymi próbkami. Dodatkowe warianty somatyczne zidentyfikowano w niezarezerwowanych genach i wystąpiły tylko u pojedynczych pacjentów (patrz Tabela S2 w Dodatku Uzupełniającym).
Sanger Sequencing dla MYD88 L265P
Sekwencjonowanie Sanger a potwierdziło ekspresję MYD88 L265P we wszystkich 26 próbkach nowotworów, w których zostało odkryte przez sekwencjonowanie całego genomu oraz w próbce od dodatkowego pacjenta, u którego limfoplazmatyczne komórki miały dowód odczytu poziomu dla MYD88 L265P, ale wariant nie spełniał kryterium wysokiego zaufania. U tego pacjenta około 10% limfoplazmatycznych komórek szpiku kostnego wykazało ekspresję MYD88 L265P. Dlatego sekwencjonowanie Sanger zidentyfikowało MYD88 L265P w próbkach nowotworu od 27 z 30 pacjentów z makroglobulinemią Waldenströma (90%) i potwierdziło brak L865P MYD88 w normalnej tkance od 10 pacjentów z parami próbek i od 9 pacjentów z niesparowanymi próbkami, dla których dostępna była prawidłowa tkanka . W przypadku 3 pacjentów z makroglobulinemią Waldenströma, którzy nie mieli ekspresji MYD88 L265P, przegląd wszystkich odczytów map i sekwencjonowania całego regionu kodującego nie ujawnił żadnych innych wariantów MYD88
[więcej w: chirurgia dentystyczna, Dentysta warszawa, stomatolog zielona góra ]

Powiązane tematy z artykułem: chirurgia dentystyczna Dentysta warszawa stomatolog zielona góra